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基于GWAS数据的阿尔兹海默病相关miRNA的识别研究

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基于GWAS数据的阿尔兹海默病相关miRNA的识别研究
论文目录
 
摘要第1-5页
ABSTRACT第5-8页
第1章 绪论第8-18页
  1.1 课题背景及研究的目的和意义第8-9页
  1.2 国内外阿尔兹海默病研究现状第9-13页
  1.3 基因芯片技术的发展及澳门美高梅真人娱乐官网第13-14页
  1.4 高通量测序技术的发展及澳门美高梅真人娱乐官网第14-16页
  1.5 本文主要研究内容第16-18页
第2章 基于GWAS数据的候选阿尔兹海默病相关miRNA的识别研究第18-26页
  2.1 引言第18页
  2.2 GWAS数据及miRNA数据的获取第18-19页
  2.3 候选AD相关miRNA的识别方法第19-21页
    2.3.1 基因组位置比对第19-20页
    2.3.2 miRNA-based分析第20-21页
  2.4 区域关联分析第21-25页
  2.5 本章小结第25-26页
第3章 候选miRNA在阿尔兹海默病人大脑组织中的差异表达研究第26-38页
  3.1 引言第26页
  3.2 RNA-seq数据的获取第26页
  3.3 基于R包的miRNA差异表达分析第26-36页
    3.3.1 DESeq包分析第27-31页
    3.3.2 edgeR包分析第31-36页
  3.4 本章小结第36-38页
第4章 miR2185p的靶基因在阿尔兹海默病人大脑中的差异表达研究第38-45页
  4.1 引言第38页
  4.2 CLIP-seq数据、基因组注释数据及基因芯片数据的获取第38-39页
  4.3 候选miRNA靶基因的预测研究第39-40页
    4.3.1 基于TargetScan工具的靶基因预测第39页
    4.3.2 候选miRNA靶基因的筛选第39-40页
  4.4 基于GEO2R工具的靶基因差异表达分析第40-43页
  4.5 本章小结第43-45页
第5章 miR2185p靶基因的功能及通路富集分析研究第45-50页
  5.1 引言第45页
  5.2 靶基因的准备及预处理第45页
  5.3 miR2185p靶基因集的功能及通路富集分析第45-49页
    5.3.1 GO功能富集分析第46-48页
    5.3.2 KEGG通路富集分析第48-49页
  5.4 本章小结第49-50页
结论第50-51页
参考文献第51-59页
附录第59-77页
攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果第77-79页
致谢第79页

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