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R语言包InfiniumPurify在肿瘤纯度估计和差异甲基化分析中的澳门美高梅真人娱乐官网

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R语言包InfiniumPurify在肿瘤纯度估计和差异甲基化分析中的澳门美高梅真人娱乐官网
论文目录
 
摘要第1-6页
Abstract第6-8页
第1章 绪论第8-11页
  1.1 肿瘤细胞纯度估计概述第8-9页
  1.2 肿瘤细胞纯度对差异甲基化分析的意义第9-10页
  1.3 本文结构安排第10-11页
第2章 R语言InfiniumPurify包的基本结构和功能第11-17页
  2.1 getPurity:基于DNA甲基化 450k芯片数据估计肿瘤细胞纯度第11-12页
  2.2 InfiniumDMC:考虑肿瘤细胞纯度来进行差异甲基化分析第12-15页
  2.3 InfiniumPurify:纯化肿瘤样本的甲基化水平第15-16页
  2.4 本章小结第16-17页
第3章 InfiniumPurify包在TCGA数据库中的澳门美高梅真人娱乐官网分析第17-34页
  3.1 研究背景和数据材料第17-19页
  3.2 肿瘤细胞纯度估计的模型与结果第19-25页
    3.2.1 getPurity:肿瘤纯度估计的模型第19-20页
    3.2.2 纯度估计模型的结果第20-25页
  3.3 差异甲基化区域估计的模型与结果第25-28页
    3.3.1 InfiniumDMC:考虑肿瘤细胞纯度的差异甲基化估计模型第25页
    3.3.2 模型结果第25-28页
  3.4 推断纯化的肿瘤甲基化的模型与结果第28-33页
    3.4.1 InfiniumPurify:纯肿瘤样本甲基化水平的估计模型第28-30页
    3.4.2 矫正纯度效应模型结果第30-33页
  3.5 本章小结第33-34页
第4章 结论与展望第34-36页
  4.1 结论第34-35页
  4.2 课题展望第35-36页
参考文献第36-39页
致谢第39页

本篇论文共39页,点击这进入下载页面
 
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