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杂合二倍体马铃薯基因组单体型组装与分析

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杂合二倍体马铃薯基因组单体型组装与分析
论文目录
 
摘要第1-7页
abstract第7-10页
英文缩略表第10-11页
第一章 引言第11-22页
  1.1 马铃薯概述第11-16页
    1.1.1 马铃薯遗传学背景第11-12页
    1.1.2 马铃薯育种现状第12-13页
    1.1.3 马铃薯基因组研究进展第13-16页
  1.2 杂合基因组组装与分型研究进展第16-21页
    1.2.1 杂合基因组组装的方法第16-18页
    1.2.2 基因组分型的方法第18-21页
  1.3 本课题研究目的第21-22页
第二章 材料与方法第22-28页
  2.1 实验材料第22页
    2.1.1 基因组测序材料第22页
    2.1.2 转录组测序材料第22页
  2.2 实验方法第22-28页
    2.2.1 测序方法与测序数据质量检测第22-23页
    2.2.2 基因组短序列组装与单体型分型方法第23-26页
    2.2.3 基因组组装与分型质量评估第26页
    2.2.4 基因组注释与评估第26-27页
    2.2.5 单体型多态性分析第27-28页
第三章 结果与讨论第28-40页
  3.1 实验结果与分析第28-36页
    3.1.1 测序数据量与质量分析第28-29页
    3.1.2 基因组短序列组装与单体型分型第29-31页
    3.1.3 基因组组装与分型质量评估第31-33页
    3.1.4 基因组注释结果第33页
    3.1.5 单体型多态性分析第33-36页
  3.2 讨论第36-40页
    3.2.1 拼接杂合基因组各方法比较第36-37页
    3.2.2 基于全基因组分型的等位基因多态性研究的优势第37-38页
    3.2.3 等位基因多态性分析在马铃薯生物学研究及育种中的澳门美高梅真人娱乐官网第38-40页
第四章 全文结论第40-41页
参考文献第41-47页
附录第47-62页
  附表1. k-mer 估计基因组大小第47-48页
  附表2. 分染色体重新组装每条染色体组装情况第48-49页
  附表3. 12对染色体共线性区域及在此区域内的等位基因第49-50页
  附表4. 12号染色体偏分离区域等位基因信息第50-51页
  附表5. 12号染色体偏分离区域等位基因功能基因注释信息第51-62页
作者简历第62-63页
致谢第63-64页

本篇论文共64页,点击这进入下载页面
 
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