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蛋白激发子MoHrip2处理水稻后的转录组分析及互作蛋白的初步鉴定

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蛋白激发子MoHrip2处理水稻后的转录组分析及互作蛋白的初步鉴定
论文目录
 
摘要第1-6页
abstract第6-10页
第一章 引言第10-16页
  1.1 激发子研究现状第10-12页
    1.1.1 激发子定义、分类和功能第10-11页
    1.1.2 激发子受体研究现状第11-12页
  1.2 蛋白互作研究方法第12-14页
    1.2.1 体内互作研究方法第12-13页
    1.2.2 体外互作研究方法第13-14页
  1.3 蛋白真核表达途径第14页
  1.4 转录组测序技术概述第14页
  1.5 苯丙氨酸途径和异黄酮对植物抗病功能的研究概述第14-15页
  1.6 本研究的目的和意义第15-16页
第二章 MoHrip2的真核表达及纯化第16-22页
  2.1 材料与方法第16-19页
    2.1.1 材料第16页
    2.1.2 方法第16-19页
  2.2 结果第19-21页
    2.2.1 MoHrip2基因克隆和真核表达载体构建第19页
    2.2.2 电转酵母及培养及蛋白诱导、收集纯化第19-20页
    2.2.3 蛋白SDS-PAGE和western-blot鉴定第20页
    2.2.4 MoHrip2真核表达蛋白的活性测定第20-21页
  2.3 讨论第21-22页
第三章 转录组测序第22-42页
  3.1 实验材料第22页
  3.2 实验方法第22-27页
    3.2.1 水稻样品的准备第22页
    3.2.2 RNA提取和质量检测第22-23页
    3.2.3 文库构建及测序第23-24页
    3.2.4 测序数据的过滤和质量控制(QC)第24-25页
    3.2.5 基因表达定量分析第25页
    3.2.6 差异基因的筛选:NOISeq法第25页
    3.2.7 差异基因GO分析第25-26页
    3.2.8 差异基因Pathway分析第26页
    3.2.9 差异基因的转录因子分析(适用于植物)第26-27页
  3.3 实验结果与分析第27-38页
    3.3.1 水稻样品的RNA质量检测第27-28页
    3.3.2 RNA-SEQ测序数据过滤和质控第28-30页
    3.3.3 测序饱和度和reads随机性第30-32页
    3.3.4 基因表达水平分析第32-33页
    3.3.5 基因维恩图第33-34页
    3.3.6 差异基因分析第34-35页
    3.3.7 差异基因聚类分析第35-38页
  3.4 差异基因功能显著性富集分析第38-41页
    3.4.1 GO富集分析第38-40页
    3.4.2 KEGG Pathway显著性富集分析第40-41页
  3.5 讨论第41-42页
第四章 转录因子与抗病基因定量检测第42-52页
  4.1 试验材料、试剂、仪器第42页
  4.2 试验方法第42-44页
    4.2.1 水稻RNA提取第42页
    4.2.2 cDNA的合成第42-43页
    4.2.3 荧光定量PCR第43页
    4.2.5 MoHrip2处理后水稻中水杨酸含量的检测方法第43-44页
  4.3 实验结果与分析第44-51页
    4.3.1 荧光定量验证黄酮途径相关基因的表达第44-46页
    4.3.2 荧光定量检测关键转录因子和特异性基因的表达第46-50页
    4.3.3 MoHrip2处理后水稻中水杨酸浓度的测定第50-51页
  4.4 讨论第51-52页
第五章 MoHrip2在水稻中互作蛋白的鉴定和验证第52-57页
  5.1 实验材料第52-53页
    5.1.1 菌株和质粒第52页
    5.1.2 实验试剂和耗材第52页
    5.1.3 培养基与试剂配方第52-53页
  5.2 实验方法第53-54页
    5.2.1 OsOlp的生物信息学分析第53页
    5.2.2 酵母双杂交第53-54页
  5.3 实验结果第54-55页
    5.3.1 生物信息分析结果第54-55页
    5.3.2 酵母双杂交结果第55页
  5.4 讨论第55-57页
第六章 全文总结第57-58页
参考文献第58-64页
致谢第64-65页
作者简历第65页

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