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基于SWATH技术的断奶仔猪肠道黏膜蛋白质组学研究

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基于SWATH技术的断奶仔猪肠道黏膜蛋白质组学研究
论文目录
 
摘要第1-8页
abstract第8-15页
英文缩略表第15-16页
第一章 引言第16-24页
  1.1 研究目的和意义第16页
  1.2 国内外研究进展第16-19页
    1.2.1 断奶应激对肠道形态发育及功能的影响第16-17页
    1.2.2 断奶应激对肠道黏膜屏障的影响第17-19页
  1.3 蛋白质组学第19-23页
    1.3.1 蛋白质组学概念及发展第19页
    1.3.2 基于质谱的蛋白质组学研究策略第19-20页
    1.3.3 蛋白质组学研究关键技术第20-23页
  1.4 研究内容和技术路线第23-24页
    1.4.1 研究内容第23页
    1.4.2 技术路线第23-24页
第二章 21日龄断奶对仔猪肠道屏障的影响研究第24-37页
  2.1 材料与方法第24-29页
    2.1.1 试剂与仪器准备第24页
    2.1.2 试验设计第24-25页
    2.1.3 样品采集与测定第25-28页
    2.1.4 数据与分析第28-29页
  2.2 结果第29-35页
    2.2.1 生长性能和腹泻率第29页
    2.2.2 肠道组织形态第29-32页
    2.2.3 肠上皮细胞结构和肠道通透性第32-33页
    2.2.4 肠道黏膜紧密连接蛋白基因表达量第33页
    2.2.5 肠道黏膜细胞因子基因表达量第33-35页
  2.3 讨论第35-36页
  2.4 本章小结第36-37页
第三章 仔猪肠道黏膜蛋白质组学的鉴定方法研究第37-46页
  3.1 材料与方法第37-39页
    3.1.1 试剂与仪器准备第37页
    3.1.2 试验材料第37页
    3.1.3 蛋白质提取和纯化方法第37-38页
    3.1.4 仔猪黏膜蛋白质组分析第38-39页
  3.2 结果与分析第39-43页
    3.2.1 不同蛋白质提取缓冲液比较第39-40页
    3.2.2 不同蛋白质纯化方法比较第40页
    3.2.3 丙酮沉淀法质谱图精度分析第40-42页
    3.2.4 不同肽段洗脱梯度比较第42-43页
  3.3 讨论第43-45页
  3.4 本章小结第45-46页
第四章 基于SWATH技术研究断奶对仔猪肠道黏膜蛋白表达的影响第46-58页
  4.1 材料与方法第46-49页
    4.1.1 试验材料第46页
    4.1.2 蛋白质提取和酶解第46-47页
    4.1.3 建立SWATH定量数据分析库第47页
    4.1.4 SWATH分析和目标数据提取第47-48页
    4.1.5 qRT-PCR检验差异蛋白的mRNA表达水平第48页
    4.1.6 数据库检索、和生物信息学分析第48-49页
  4.2 结果第49-54页
    4.2.1 蛋白质浓度和条带分析第49-50页
    4.2.2 mapDIA软件重新组装离子第50页
    4.2.3 肠道黏膜蛋白鉴定结果第50页
    4.2.4 差异表达蛋白GO功能分析第50-51页
    4.2.5 差异表达蛋白KEGG通路分析第51-54页
    4.2.6 qRT-PCR验证差异蛋白第54页
  4.3 讨论第54-56页
    4.3.1 断奶应激诱导细菌感染肠道第54-55页
    4.3.2 断奶应激引起仔猪物质代谢紊乱第55-56页
    4.3.3 断奶应激打破细胞稳态第56页
  4.4 本章小结第56-58页
第五章 全文结论第58-59页
  5.1 结论第58页
  5.2 有待深入研究的问题第58页
  5.3 主要创新点第58-59页
参考文献第59-68页
附录第68-79页
附图1 KEGG富集到的上皮细胞细菌入侵通路图第68-69页
附表2 断奶应激相关的差异蛋白列表第69-79页
致谢第79-80页
作者简历第80页

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